La méthodologie de notre recherche vise à articuler une analyse a priori, la conception de situations de classe et une analyse a posteriori de ces situations vécues avec des élèves. Nous avons donc conçu une ingénierie didactique (Artigue 1988) et construit des situations dans lesquelles des lycéens ont été amenés à concevoir des protocoles pour les différentes disciplines :

• Un TP de chimie : Un indicateur coloré acide-base : le bleu de bromothymol (BBT)

• Un TP de biologie : La réaction antigène-anticorps

• Un T.P. de paléontologie : La mesure de l’angle facial pour identifier différentes espèces de la lignée humaine

• Un TP de physique : Identifier et caractériser un dipôle inconnu

Ces situations sont fondées sur l'analyse des protocoles formalisée sous la forme d'arbres des tâches